O Instituto Nacional de Pesquisas Educacionais Anísio Teixeira (Inep) é o responsável pela produção dos dados da Prova Brasil. No que diz respeito a proficiência (aprendizado) dos alunos, até 2011, o Instituto apresentava para as escolas a distribuição percentual de alunos em 9 (Língua Portuguesa) ou 13 (Matemática) níveis. Cada um dos níveis era medido pela variação de 25 pontos na escala Saeb.

A medida dos níveis iniciava-se na pontuação 125, pois valores inferiores não são típicos para alunos do 5º ano. Por exemplo, o nível 5 da escala correspondia ao intervalo de 225 a 250 pontos na escala Saeb.

Apesar da escala Saeb variar até a pontuação de 500, as habilidades mais complexas em Língua Portuguesa estavam concentradas no nível 9 (325 a 350) e para matemática no nível 12 (400 a 425). As habilidades de níveis superiores estavam relacionadas ao currículo do Ensino Médio e não são avaliadas pela Prova Brasil.